Ein kleines Juwel des Franziskanergymnasiums ist die so genannten "Professorenbibliothek", welche an das Professorenzimmer anschließt. Bis zu 4 Meter hohe Regale beherbergen auf über 120 m² annähernd 20.000 Bände aus allen Fachbereichen. Lange Jahre war die Nutzung der Bibliothek ausschließlich dem unterrichtenden Personal der Schule vorbehalten; die Buchrecherche erfolgte über den von Bibliothekar P. Ambros Martini erstellten Zettelkatalog.

Nunmehr ist die digitale Erfassung dieses Bücherschatzes abgeschlossen, sodass der Bestand unter diesem Link eingesehen werden kann.

Anfragen hinsichtlich einer eventuellen Leihe oder aber einer Besichtigung der Professorenbibliothek können an den aktuellen Bibliothekar Prof. Reinhard Pichler unter bibliothek@franziskanergymnasium.it gestellt werden.